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[2] 董文豪,宫晓炜,郑福英,刘永生,张磊,张小丽,陈启伟,马小军.猪源地衣芽孢杆菌的分离筛选及其特性[J].甘肃农业大学学报,2021,56(05):8-17.
[3] 张磊,宫晓炜,郑福英,刘永生,董文豪,张小丽,陈启伟,马小军.鸡源唾液乳杆菌的分离鉴定及生物学特性分析.中国兽医科学,2021,(07),865-874.
[4] 张小丽,麻强生,焦世璋,宋晓育,马小军.鲟源鲁氏耶尔森菌多位点序列分型及耐药谱测定[J].水产科学,2021,40(03):394-402.
[5] 马玉俊,梁子敬,李杰,张禹,张小丽,李建喜,张景艳,马小军.坚强芽胞杆菌-CX10安全性评价[J].动物医学进展,2020,41(09):36-41.
[6] 王加冕,马小军,张小丽,时帅峰.甘肃省永昌县舍饲绵羊乳房炎源大肠杆菌的分离鉴定及药敏试验[J].甘肃农业大学学报,2020,55(
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[7] 贺佳慧,白满元,郭慧琛,孙世琪,张小丽,马小军.兔抗O型口蹄疫VLPs酶标抗体的制备及初步应用[J].动物医学进展,2019,40(01):20-24.
[8] 陈佳佳,张小丽,马小军,唐然,贺佳慧,李娇阳,张禹.感染金黄色葡萄球菌小尾寒羊外周血白细胞和乳腺组织中TLRs基因的表达[
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[10] 唐然,张小丽,马小军,李发弟,陈富强,贺佳慧,陈佳佳,李骄阳.大肠杆菌感染诱导的小尾寒羊外周血白细胞TLR1～5基因差异表达[
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[11] 马小军,陈富强,张小丽,李发弟,唐然,张晨,宋晓育,张欣.金黄色葡萄球菌对小尾寒羊乳腺组织TLR2表达的影响[J].华北农学报,2016,31(
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[13] 张小丽,宋晓育,马小军,陈富强,张晨,张欣.甘肃地区绵羊MHC-DRB1基因第2外显子多态性与乳房炎的相关性分析[J].浙江农业学报,2016,28(02):221-227.
[14] 陈富强,张小丽,李发弟,杨勃,唐然,张晨,张欣,宋晓育,马小军.TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺组织中的表达[J].农业生物技术学报,2016,24(03):349-356.
[15]祝俊鹏,杨彬,兰喜,柳纪省,马小军.猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析[J].华北农学报,2015,30(02):72-77.
[16] 杨勃,兰喜,杨彬,柳纪省,单兴娜,刘伟,王恩丽,张韵,马小军.猪源札幌病毒衣壳蛋白的原核表达及免疫原性检测[J].中 国兽医科学,2014,44(12):1273-1278.
[17] 吕伟丽,马小军,张小丽,张国华.绵羊TLR4基因的遗传多态性分析[J].江苏农业学报,2014,30(04):790-795.
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[21] 姜力飞,马小军,李富强,罗秀刚,时帅锋,王恩丽.合作猪SLA-DQB基因第3外显子多态性分析[J].甘肃农业大学学报,2014,49(01):31-34+40.
[22] 王恩丽,兰喜,刘伟,杨彬,柳纪省,马小军.猪嵴病毒441株3D基因的克隆及序列分析[J].生物技术通报,2013(11):148-152.
[23] 李富强,张小丽,马小军,罗秀刚,岳燕,姜力飞,王恩丽,时帅峰.合作猪干扰素γ基因的克隆与序列分析[J].华北农学报,2013,28(04):31-36.
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[28] 马小军,张小丽,王立贤,刘宗平.松辽黑猪、大白猪免疫指标和生产性能的比较研究[J].中国畜牧兽医,2011,38(02):52-56.
[29] 李娟娟,马小军,王立贤,张小丽,李小飞.合作猪Nramp1基因第六内含子多态性分析[J].甘肃农业大学学报,2010,45(02):10-13+24.
[30] 马小军,张小丽,吕世文.锗硒对绵羊血液中某些微量元素含量的影响[J].甘肃畜牧兽医,2007(01):19-21.
[31] 马小军,王立贤,刘宗平.mRNA差异显示技术及其在动物科学研究中的应用[J].畜牧与兽医,2005(04):51-54.
[32] 马小军,王立贤,刘宗平.免疫应答与猪抗病育种[J].中国畜牧兽医,2005(02):40-42.
[33] 马小军,张小丽,张德寿.锗硒对绵羊血液抗氧化酶活性和增重率的影响[J].中国兽医科技,2003(09):50-52.
[34] 马小军,卢吉平,陈怀涛,张小丽.家兔氟乙酰胺中毒的血清生化指标变化[J].动物医学进展,2003(04):103-104.
2.专著
[1] 兽医临床诊断（第三版），北京：中国农业出版社，2022,1（参编）
[2] 动物临床诊断学（第二版），北京：中国林业出版社，2021,1（参编）
[3] 动物临床诊断学（第一版），北京：中国林业出版社，2013,7（参编）
[4] 2012年执业兽医资格考试单元强化自测与详解-临床兽医，北京：中国农业出版社,2012,5（参编）
[5] 兽医常见毒物检验技术，杨凌：西北农林科技大学出版社，2010,10 （参编）
[6] 兽医临床诊断学（第二版），北京：中国农业出版社，2010,8 （参编）
[7] 兽医全攻略-羊病学，北京：中国农业出版社，2009,8（参编）
[8] 牛病诊疗原色图谱，北京：中国农业出版社，2008,8 （参编）
[9] 动物中毒病学，北京：中国农业出版社，2006,9（参编）
[10] 现代动物营养代谢病学，北京：化学工业出版社，2003 (参编)
[11] 动物中毒与营养代谢病学，兰州：甘肃科技出版社，2001（参编）
3.专利
[1] 检测藏绵羊腐蹄病抗性等位基因的特异性扩增引物及其检测试剂盒和检测方法（发明专利，专利号CN101532061）2010年1月13
[2] 藏绵羊腐蹄病抗性等位基因PCR-SSCP检测试剂盒（实用新型专利，专利号CN201381325）2009年9月16
